Contexte scientifique et missions
Les interactions entre fourmis et pucerons offrent un cadre de travail de référence pour étudier les relations mutualistes et antagonistes (Stadler and Dixon, 2005). Les pucerons peuvent fournir aux fourmis aussi bien du miellat sucré ou être des proies protéinées, selon des relations mutualistes ou antagonistes. Lorsque les fourmis utilisent les pucerons comme source de miellat, elles les entretiennent par une défense agressive contre leurs ennemis naturels (Chaubet, 2024).
Dans le cadre du projet Diver’ant, plusieurs laboratoires (Angers, Rennes, Lleida, Avignon) étudient le potentiel de la féverole pour détourner les fourmis des colonies de pucerons cendrés en verger de pommiers. L’hypothèse est que l’implantation de féverole offre des sources de nectar extrafloral et de miellat alternatif aux fourmis, qui délaissent alors les pucerons du pommier, favorisant ainsi leur contrôle biologique (Pålsson et al., 2020).
Près de 600 fourmis ont été collectées aux printemps 2025 et 2026 dans une trentaine de vergers en France et en Espagne, dans différentes zones (bande de féverole, arbres avec des pucerons) et à différentes dates (d’avril à juillet). En parallèle, le contenu gastrique d’une centaine de fourmis nourries de manière contrôlée au laboratoire a été analysé. Une fois analysés chimiquement, les profils métaboliques de ces fourmis permettront de développer une approche d’inférence du statut nutritionnel individuel (Luquet et al., 2021).
Missions du stage
L’étudiant·e sera en charge de :
- L’analyse biochimique des fourmis :
- Extraction et analyse du métabolome des fourmis collectées en 2026, à partir de protocoles déjà mis au point (extraction liquide/liquide centrée sur la phase polaire, dérivatisation par BSTFA, injection en GC-EI-TOF).
- Le développement d’une procédure originale de retraitement des données chromatographiques (déconvolution, déréplication) via deux approches :
- Une approche ciblée
- Une approche non ciblée
- Le développement de compétences bio-informatiques liées à l’utilisation des logiciels de métabolomique, en lien avec l’équipe encadrante.
- La mise en place d’analyses statistiques sous R pour relier la distribution des régimes alimentaires :
- À la disponibilité des ressources dans l’aire d’affouragement des fourmis
- Aux besoins nutritionnels de la fourmilière, qui évoluent au cours de la saison
- La participation aux relevés mensuels de la flore et de l’entomofaune (5 à 10 jours au total) dans les vergers du site d’Avignon pour l’acquisition de données sur l’évolution saisonnière des ressources disponibles pour les fourmis (miellat de puceron, nectar floral et extrafloral)
Localisation :
Unité « Plantes et Systèmes de Culture Horticole », INRAE, Domaine de Saint-Paul, site Agroparc, 228 route de l’Aérodrome, 84000 Avignon (Vaucluse)
Début du stage : 01/02/2027
Durée : 6 mois
Profil recherché
- Formation en biochimie ou en écologie chimique
- Analyse de données sous R
- Des compétences en bio-informatique seraient un atout
Encadrement :
- Doriane Dumont (biochimie)
- Alan Kergunteuil (écologie chimique)
- Pierre Franck (écologie trophique)
Conditions de travail
- Gratification selon la réglementation française en vigueur (4,5 €/h, 35 h/semaine)
- Véhicule de service si déplacement
Modalités de candidature
Envoyer un CV, une lettre de motivation et les relevés de notes du M1 avant le 11/10/2026 à :
- Doriane Dumont : doriane.dumont@inrae.fr
- Pierre Franck : pierre.franck@inrae.fr
- Alan Kergunteuil : alan.kergunteuil@inrae.fr
Les dossiers de candidature seront examinés au fur et à mesure de leur réception.
Références
- Chaubet, B. (2024). Pucerons et fourmis : mutualisme. Encyclop’Aphid : l’encyclopédie des pucerons. Lien
- Li, Y. et al. (2021). Spectral entropy outperforms MS/MS dot product similarity for small-molecule compound identification. Nature Methods, 18, 1524–1531. DOI:10.1038/s41592-021-01331-z
- Louail, P., Rainer, J. (2026). LC-MS data preprocessing and analysis with xcms. Lien
- Luquet, M. et al. (2021a). Inferring insect feeding patterns from sugar profiles: a comparison of statistical methods. Ecological Entomology, 46, 19–32. DOI:10.1111/een.12971
- Luquet, M. et al. (2021b). Aphid honeydew may be the predominant sugar source for Aphidius parasitoids even in nectar-providing intercrops. Biological Control, 158, 104596. DOI:10.1016/j.biocontrol.2021.104596
- Stadler, B., Dixon, A.F.G. (2005). Ecology and Evolution of Aphid-Ant Interactions. Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics. DOI:10.1146/annurev.ecolsys.36.091704.175531
- Pålsson, J. et al. (2020). Aphid-infested beans divert ant attendance from the rosy apple aphid in apple-bean intercropping. Scientific Reports, 10, 8209. DOI:10.1038/s41598-020-64973-7